Десять лет назад родители Наруто спасли деревню Коноху от разрушения демоном Девятихвостым Лисом. Они запечатали демона в своём новорождённом ребёнке. Но цена за это была высока - погибло множество воинов, в том числе лидер деревни Минато Намикадзе и его жена Кушина Узумаки.
Прошло много лет. Наруто вырос и пережил множество приключений, сумев справится с демоном внутри него. Но в один день, группа ниндзя известных как Акацуки нападает на Коноху. И никто не может понять, почему среди Акацуки оказываются сильные воины, которые должны были быть мертвы.
Наруто и его друзьям удаётся с трудом контратаковать и спасти деревню, но неожиданно Тоби применяет странное Додзюцу, жертвами которого оказываются Наруто и Сакура...
Друзья приходят в себя в Конохе. В другой Конохе. Здесь живы родители Наруто, но родители Сакуры мертвы, здесь клан Саске не уничтожен и он продолжает жить в деревне... Что же теперь делать Наруто? Захочет ли он вернуться в свой родной мир?